L'écotoxicologue peut exercer en solo ou au sein d'un service spécialisé, rattaché à la direction sécurité environnement ou produit, ou dépendant des directeurs industriels. Il ou elle peut aller sur le terrain mais travaille surtout au sein d'un laboratoire pour faire des tests ou analyser des échantillons. Les employeurs publics ou privés peuvent être des bureaux d'études, des organismes de recherche, des grandes entreprises industrielles ou des services du ministère chargé de l'environnement. L'écotoxicologue peut exercer à distance, en bureau ou sur le terrain.
